Com um nome que coincide claramente com o cenário mítico do Santuário do Bom Jesus em Braga, as suas origens estão ligadas às aparições marianas na zona. Foi fundado em 1523 por Alonso de Piña, prior da vizinha Santa María a Real de Xunqueira de Ambía. O mestre encarregado de sua construção foi Bartolomé de Nosendo, pedreiro de origem portuguesa, que já havia trabalhado em Santo Estevo de Sandiás e na mesma colegiada de Ambía.

Ocupada desde o início e para sempre pela ordem franciscana (1523-1835), a ideia inicial era construir apenas a igreja. Finalmente o prior erigiu um mosteiro completo.

Do conjunto monumental, a igreja é o edifício mais bem preservado, sendo a sua cobertura a mais notável no exterior. Tem uma decoração relevada no estilo manuelino, um gótico tardio muito característico de Portugal que foi importado pelo mestre Bartolomeu.

Formas de plantas entrelaçadas com grotescos (seres fantásticos com aparência humana ou animal) e arcos de copa (em forma de curva com bico pontiagudo) convivem em um clima harmonioso no centro do edifício. No topo está uma enorme torre à esquerda encimada por uma torre sineira. No seu interior tem magnífica talha escultórica, retábulos e murais.

Ao contrário da igreja, o claustro não está em tão boas condições. No entanto, ainda podemos ver a sua planta retangular com os 28 arcos que a compõem. O esquema da fachada principal também se repete aqui: arcos de dossel e decoração baseada em elementos da natureza, plantas e animais.

O edifício monástico anexo consistia em uma grande cozinha, dependências para a comunidade na parte superior e inferior dos pátios, celeiros e adegas. No ano de 1668 sofreu um tremendo incêndio que deixou os frades sem onde se refugiar. Logo foi reconstruída e abriga uma faculdade de filosofia desde 1797, desempenhando um papel de destaque na receção dos clérigos que fugiam da França por causa da revolução.

O seu declínio começou durante a guerra contra os franceses (século XIX), onde as tropas invasoras destruíram a igreja. Em 1813, outro incêndio acabaria por destruir o que restava do mosteiro. Com o confisco viria o seu abandono final. Seria então vendido a quem talvez optar por vender as suas pedras. Encontra-se atualmente em processo de declaração de Sítio de Interesse Cultural.